早年
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薛定諤1887年生於奧地利維也納附近的埃德伯格，父親魯道夫·薛定諤是油布和防水布工廠主，園藝家；母親格魯吉亞娜·艾米莉·布蘭達(娘家姓：鮑爾)（維也納科技大學化學教授亞歷山大·鮑爾的女兒）。他是他們唯一的孩子。
薛定諤的母親是一半奧地利血統，一半英國血統。他的父親信仰天主教，母親信仰路德教派。他本人是一名無神論者。[8]
1898年進入文理高中，1906年至1910年在維也納大學學習物理與數學並在1910年取得博士學位。此後在維也納物理研究所工作，當時的同事有弗蘭茨·塞拉芬·埃克斯納（Franz Serafin Exner）、弗里德里希·哈澤內爾（Friedrich Hasenöhrl）、弗里茨·科爾勞施（Fritz Kohlrausch）。在大學期間同園藝家弗蘭茨·弗里梅爾（Franz Frimmel）保持深厚友誼。幾乎同時學習英語和德語，因為父母都在家講這兩種語言。
1911年，薛丁格成為埃克斯納的助理[9]。在薛丁格幼年時期，他深受叔本華影響，因此廣泛閱讀叔本華作品，一生對色彩理論、哲學、東方宗教深感興趣。
中年
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1914 年，薛定諤取得了特許任教資格（venia legendi）。薛定諤在1914年至1918年參加了第一次世界大戰。此後在耶拿大學、斯圖加特大學、布雷斯勞大學和蘇黎世大學教書。特別是在蘇黎世大學他所擔任的理論物理學的教授以前曾由愛因斯坦和馬克斯·馮·勞厄擔任過。在這裡他提出了著名的薛定諤方程，創立了波動力學學說用以來描述量子力學。
1920年4月6日他同安娜瑪麗·貝特爾（Annemarie Bertel）結婚。在同一年，薛丁格在耶拿成為馬克斯·維恩（英語：Max Wien）的助理，並在1920年9月成為了副教授（ausserordentlicher Professor，ao. Prof.）。1921年，在布雷斯勞（今弗羅次瓦夫）他成為正教授（ordenticher Professor，o. Prof.）。
1921年，他搬到了蘇黎世大學。1926年1月，薛丁格在物理年鑑發表文章「以特徵值問題處理量子化理論」（Quantisierung als Eigenwertproblem）來處理波動力學，並引入了現在稱之為薛丁格方程式。在本文中，他「推導」了不含時的波動方程，並證明它正確地給出了類氫原子的能量特徵值。本文被視二十世紀最重要的成就之一，創造出量子力學的革命，並延伸到物理及化學的各個領域。第二篇文章在四個星期後發表，給出了量子諧振子、剛體及雙原子分子的解，並給出了薛丁格方程式一個新的推導方式。在五月發表的第三篇文章中，薛丁格證明了他的做法等價於海森堡，並處理了斯塔克效應。第四篇文章說明了如何處理隨時間變化的系統，例如散射問題。在此論文中，為了避免四次及六次的微方項，薛丁格引入了波動方程的複數解（量子力學可說是從此由實轉複）。在引入了複數後，神奇的事發生了，波動方程的一切就在他腳邊。（他最終將微方項的次數降為一） [10]這些文章在物理界被公認為意義重大，對他的職業生涯和成就具有重大的意義。薛丁格本人並不太喜歡量子理論的意涵，對於量子力學的機率詮釋，他說：「我不喜歡它，對引入它我感到抱歉。」[11]
1927年薛定諤遷往柏林，接替馬克斯·普朗克在洪堡大學擔任理論物理學教授，並成為了普魯士科學院院士。在那裡他感受到了自由進行科學研究的濃厚氣氛。當時在柏林匯聚了世界頂尖的物理學家，比如他的同事維克托·維斯科普夫。在納粹黨1933年奪取政權後，薛定諤決定離開德國移居英國牛津，在牛津大學莫德林學院擔任訪問學者，同年他獲得了諾貝爾物理學獎。
晚年
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1934年，薛定諤在普林斯頓大學講學，校方希望能夠聘請他，但薛定諤拒絕了。之後，他要前往愛丁堡大學當講師，但簽證延誤，最後，1936年他只好在奧地利格拉次的大學授課。1938年薛定諤由於德奧合併而離開奧地利並遷往愛爾蘭都柏林，在那裡他於1940年建立了理論物理學院並一直擔任主任。
1944年薛定諤撰寫了《生命是什麼？》（What is Life?）。發現DNA雙螺旋的詹姆斯·杜威·沃森與弗朗西斯·克里克表示受薛丁格影響頗深。[12][13]
1956年返回維也納，在維也納大學理論物理研究所教學直到去世。當他參加完在阿爾卑巴赫（Alpbach）舉行的高校活動後，由於當地風景優美而決定死後葬在此地。薛定諤因患肺結核在1961年1月4日病逝於維也納，死後如願被埋在了阿爾卑巴赫，他的墓碑上刻着以他命名的薛定諤方程。
個人生活
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薛定諤在1920年4月6日和安娜瑪麗·貝特爾結婚[14]。
1938 年，薛定諤移民愛爾蘭時，為自己、妻子和另一名女性希爾德·馬奇辦理了簽證。馬奇是一位奧地利同事的妻子，1934 年薛定諤與她生下了一個女兒[15]。 薛定諤親自寫信給愛爾蘭總理埃蒙·德·瓦萊拉，為馬奇辦理簽證。1939 年 10 月，三人組在都柏林正式定居。[15]
薛定諤患有結核，在1920年代曾幾次在阿羅薩的療養院中休養，波方程也是在療養院推導出來的[16]。
安娜瑪麗和薛定諤的墓，上面刻有薛定諤方程
i
ℏ
∂
∂
t
Ψ
=
H
^
Ψ
{\displaystyle i\hbar {\frac {\partial }{\partial t}}\Psi ={\hat {H}}\Psi }
薛定諤在73歲時，於1961年1月4日因結核逝世於維也納，葬在奧地利阿爾卑巴赫的天主教墓園中。薛定諤並不是天主教徒，但因其宗座科學科學院的會員身分而被允許葬於此處[17]。薛定諤的妻子安娜（生於1896年12月3日）在1965年10月3日逝世。